Tiếp nối phần 1, CLB nhạc nhẹ với các thành viên: Yui (guitar), Mio (bass), Ritsu (trống), Tsumugi (keyboard) và Azusa (guitar phụ) tiếp tục cuộc sống học đường năm cuối cấp đầy tiếng cười, bánh ngọt và... trà sữa. Họ vẫn chơi nhạc, luyện tập (kiểu “có như không”), và chuẩn bị cho các buổi biểu diễn tại lễ hội văn hóa hay tốt nghiệp. Tuy nhiên, mùa chia ly đang đến gần. Trong khi Yui, Mio, Ritsu và Mugi sắp ra trường, Azusa vẫn còn ở lại, tạo nên bầu không khí vừa ấm áp vừa man mác buồn. Dù phần lớn thời lượng vẫn là những mẩu chuyện đời thường dễ thương, Season 2 cũng dành không ít thời gian để khắc họa tình bạn sâu sắc và sự gắn bó giữa các thành viên – đặc biệt là nỗi sợ bị bỏ lại của Azusa, và cách các chị luôn cố gắng để lưu giữ kỷ niệm cho cô. Phần 2 kết thúc bằng lễ tốt nghiệp và buổi diễn cuối cùng – một khoảnh khắc cảm xúc đỉnh cao, trọn vẹn và nhẹ nhàng đúng chất K-On!